一体化超纯水反渗透膜系统在运行过程中，要严格监控水质，保证进水前处理措施稳定运行可靠。
如通水量下降或产水水质不合格，应及时清洗或更换反渗透膜元件。一体化超纯水设备反渗透膜使用注意事项可从以下几个方面进行：
①硬度效应。
像碳酸钙、硫酸钙这样的钙镁离子的盐类，在水中只有很小的溶解度，在反渗透膜的正常工作过程中，由于工作水在膜中被浓缩，各种盐类也会被浓缩，当盐分达到饱和浓度时，系统中的水通量下降，脱盐率降低，膜系统压差增大，严重影响膜的使用。
②胶质物质效应。
水溶液中的胶质主要有粘土、胶体硅、金属氧化物(氧化铁、氧化铝)等，都会在工作层形成胶体污垢或水垢，严重影响生产水量、脱盐率、膜系统压差。
③有机物质作用。
有机物质在水溶液中的吸附在膜表面形成有机垢，导致水通量下降。由于有机物质在预处理过程中不易清除，因此在选择反渗透水源时应予以重视。
④pH值的影响。
不同的RO膜有其各自的pH值范围。如果超过了它的范围，可能会引起破环性的问题，因此，在使用时，应密切注意进水pH值和设备使用pH值的范围。
⑤水温效应。
RO膜对温度的变化反映十分明显，水温越高水通量就越大，但是脱盐率就会下降，水温越低，水通量越小，在使用中就会遇到水温和水量的变化，这是一个正常现象。
⑥进水盐浓度的影响。
进水盐浓度越高，其渗透压也越大，工作时保证水通量所需的压力越大，当渗透压与高压泵的出水压力相等时，系统不再产水，同时进水中的盐浓度越高。
